Agrégé de lettres classiques, docteur ès lettres, Alain Pagès est professeur émérite à l’université de la Sorbonne nouvelle – Paris 3. Directeur des Cahiers naturalistes, il est responsable de « l’équipe Zola » de l’ITEM (Institut des textes et manuscrits modernes, CNRS).
Il est l’auteur de différents ouvrages qui portent sur l’histoire du mouvement naturaliste ou sur l’engagement d’Émile Zola dans l’Affaire Dreyfus.
Après avoir publié, en collaboration avec Brigitte Émile-Zola, les lettres adressées par Zola à Jeanne Rozerot, il a poursuivi cette entreprise en éditant, chez Gallimard, en 2014, le recueil des lettres inédites de Zola à sa femme, Alexandrine. Le volume, qui a reçu un excellent accueil de la part de la presse littéraire, a obtenu le prix Sévigné 2015.